Herşey 1999 Martında Gooseman ile cliffe’nin Anti-Terörizm konulu yeni bir Half-Life mod’u yapmak için konuşmalarıyla başladı. Öncelikle isim beğenildi. Counter-Strike olmasaydı neler mi olurdu? Counterrorism, Strike Force, fRAG HEADS, Counter-Terror, Terrorist wars, Terror-Force, veya Counter Force.
Planethalflife.com’da site için hazırlıklar sürerken, bu mod kısa sürede bir çok kişinin ilgi odağı oldu ve ilk beta 19 Haziran 1999′da kullanıcılara sunuldu. İlk başta birbirine çok benzer iki model olduğundan hangisi terörist, hangisi CT karıştırıldığı söyleniyordu. Eylül 1999′da şimdiki Leet (L337) modelinin ilk versiyonu olan Arab eklendi.
Beta 4 ile beraber, yeni telsiz komutları eklendi. Arada geçen her beta versiyonda silahların bir kısmı değiştirildi, yenileri eklendi. Gelen isteklere göre CS takımı kuşkusuz en çok ilgi çeken multiplayer modunu yeniledi. Suikast, Bombalama ve Kaçış senaryoları eklendi. Modeller giderek biraz daha gerçeğe yakınlaştırılıp, model tipi arttırılıyordu.
Haziran 2000′de Sierra, Counter-Strike’ı paketlerine eklemeye başlamıştı bile.
8 Kasım 2000 tarihi, CS için bir dönüm noktası olma şerefini, beta kısımlarını bırakmasıyla aldı. Oyunher yönüyle baştan yaratılmış, modeller Half-Life’ın tarihinde gördüğü en iyi halini almış, yeni silahlar eklenmiş, 4′ü CT, 4′ü T olmak üzere 8 skini seçebileceğiniz ve ülkemiz için ne yazikki geçerli olmasa da para ile satılsaydı, oyun tarihinde en çok satabilecek düzeye gelmişti.
13 Mart 2001 de oyunda bulunan bugların düzeltilmesi ve 512′lik kaplama teknolojisi kullanılarak hazırlandı. 1.1 versiyonu gerek görsel zenginlik, gerekse minimum bug ile
piyasaya sunuldu.